В недавнем исследовании, опубликованном в журнале Nature Aging, исследователи проанализировали данные о трех вспышках SARS-CoV-2 в домах престарелых в Бельгии с высокими показателями летальности (CFR, от 209 до 35%), чтобы выявить факторы риска и определить генетическую сигнатуру. смертельного заболевания после коронавируса 2019 (COVID-19) после вакцинации.
Изучать: Иммуновирусный скрининг и скрининг окружающей среды выявляют действенные факторы риска смертельного COVID-19 при вспышках в домах престарелых после вакцинации. Изображение предоставлено: Ground Image/Shutterstock.com
Фон
Вспышка тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса 2 (SARS-CoV-2) связана с высокими показателями смертности среди проживающих в домах престарелых в результате воздействия преклонного возраста, слабости, сопутствующих заболеваний, полипрагмазии и нарушения иммунной функции.
Вакцины против COVID-19 придали иммунитет всем людям, в том числе пожилым, от последствий тяжести COVID-19. Однако факторы, повышающие риск смертности от инфекций SARS-CoV-2 у лиц, вакцинированных против COVID-19, широко не изучались и требуют дальнейших исследований.
Об исследовании
В текущем национальном эпиднадзоре исследователи изучили факторы риска и генетические изменения смертельного COVID-19 после вакцинации.
Количественная полимеразная цепная реакция (ПЦР) использовалась для обнаружения SARS-CoV-2 в мазках из носоглотки, полученных от участников, и было проведено полногеномное секвенирование (WGS) для выявления причинного варианта SARS-CoV-2.
Incinerator for governmental organizations, non-profit organizations, international contractors, logistics organizations, military, pet cremation business owners, etc. including war zone like Iraq, Afghanistan, Somalia, South Sudan.
Кроме того, был проведен филогенетический анализ для определения генетической клады. Первичным исходом была смерть, связанная с COVID-19, оцениваемая в соответствии с критериями Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ).
Многопараметрическое логистическое регрессионное моделирование было выполнено для демографического и клинического профилирования COVID-19. Предикторы смертности проверялись с использованием статистики Каплана-Мейера и регрессионной модели пропорциональных рисков Кокса.
Кроме того, иммуновирусные профили клеток слизистой оболочки носа были оценены с использованием цифровой транскриптомики nCounter для выявления потенциальных биомаркеров опасного для жизни поствакцинального COVID-19, на которые можно ориентироваться при разработке методов лечения.
Кроме того, был проведен отбор проб аэрозолей из окружающей среды. Результаты сравнивали с общедоступными наборами данных секвенирования РНК (RNA-seq). Дома престарелых предоставили медицинские карты участников для анализа демографических и клинических данных.
Все участники получили дозы вакцины BNT162b2 от Pfizer. Кроме того, анализы чувствительности включали только ПЦР-положительные и двухдозовые вакцины BNT162b2.
Полученные результаты
Наиболее прогностическая модель смертности, связанной с COVID-19, включала возраст, принадлежность к мужскому полу, интерферон бета-1 (IFNB1), ангиотензинпревращающий фермент 2 хозяина (ACE2), открытую рамку считывания 7a (ORF7a), транскрипты SARS-CoV-2, SARS. Варианты -CoV-2 Gamma и Mu и позднее начало инфекции (положительный результат на SARS-CoV-2 с помощью ПЦР через неделю после эпидемии SARS-CoV-2).
Результаты показали, что терапия, нацеленная на IFNB1, может быть разработана и должна быть начата в течение первых дней после заражения для достижения наилучших результатов.
Каждая вспышка SARS-CoV-2 возникла в результате одного и того же исходного события, но с разными вызывающими беспокойство вариантами SARS-CoV-2 (VOC), т. е. гамма и дельта, и представляющими интерес вариантами (VOI), т. е. Mu. SARS-CoV-2 был идентифицирован среди образцов аэрозолей из помещений, используемых жителями и персоналом, в течение 52 дней после первичного заражения. Аналогичные результаты наблюдались при анализе чувствительности.
Помимо интерферона-λ2 (IFNL2) и IFNB1, были повышены гены, экспрессируемые преимущественно клетками системы врожденного иммунитета, в том числе экспрессируемые (i) макрофагами и моноцитами [C-X3-C motif chemokine receptor 1 (CX3CR1); tumor necrosis factor superfamily number 15 (TNFSF15); C-type lectin domain containing 6A (CLEC6A); intelectin 1; and leukocyte immunoglobulin-like receptor b5 (LILRB5)](ii) дендритные клетки [X-C motif chemokine receptor 1 (XCR1)]и (iii) естественные клетки-киллеры [Thy-1 cell surface antigen (THY1); cadherin 5; the cluster of differentiation 160 (CD160); beta-1,3-glucuronyltransferase 1 (B3GAT1); the neural cell adhesion molecule 1 (NCAM1); and C-C motif chemokine ligand 3 (CCL3)].
Кроме того, гены В-клеток [complement receptor type 2 (CR2), CD19, CD70, CD79A, CD79B, and paired box 5 (PAX5)]регуляторные Т-клетки [prostaglandin E receptor 4 (PTGER4) and forkhead box P3 (FOXP3)]и цитотоксические Т-клетки (PTGER4 и эомезодермин) были значительно повышены при летальном исходе COVID-19.
Результаты показали, что у пожилых вакцинированных смертельный COVID-19 характеризуется усиленными врожденными и клеточно-опосредованными иммунологическими реакциями. Напротив, активность главного комплекса гистосовместимости (MHC) класса I была снижена на функциональном, эпигеномном и транскриптомном уровнях при фатальном COVID-19.
Наиболее подавленные гены представлены эпителиальными клетками слизистой оболочки (CD9, полимерный рецептор иммуноглобулина (PIGR) и муцин-1 (MUC1), что указывает на повреждение эпителия слизистой оболочки, связанное с SARS-CoV-2.
Кроме того, антисмысловая активность SARS-CoV-2 была избирательно увеличена в случаях с летальным исходом, что указывает на усиление внутриклеточной репликации вируса. Повышенная экспрессия регуляторного фактора интерферона 7 (IRF7) и ассоциированного с лейкоцитами иммуноглобулиноподобного рецептора 1 (LAIR1) и сниженная экспрессия IRF3 также наблюдались со значительным обогащением путей дифференцировки регуляторных Т-клеток (Treg) и Т-хелперов 17 (Th17). .
Это открытие также показало, что передача сигналов интерлейкина-6 может быть «нисходящей» терапевтической мишенью у пациентов с COVID-19 со сверхэкспрессией IFNB1.
Заключение
В целом результаты исследования выявили факторы риска и генетические изменения, лежащие в основе смертельного COVID-19. Результаты могут помочь в разработке лекарств, способствовать оценке риска смертельного COVID-19, помочь разработать индивидуальные стратегии и снизить бремя COVID-19 для здоровья.
